Giriş

Genetik analizler, özellikle DNA mutasyonlarının tespiti ve incelenmesi, modern biyoinformatik çalışmalarının önemli bir parçasıdır. Bu analizler, genetik hastalıkların teşhisi, evrimsel biyoloji çalışmaları ve hatta adli tıp gibi birçok alanda kullanılır.

Ancak, bu analizlerin doğru ve güvenilir olması için, DNA dizilerinin öncelikle uygun bir şekilde hazırlanması ve temizlenmesi gerekir. Bu süreç, verilerin kalitesini artırır ve analiz sonuçlarının daha tutarlı olmasını sağlar.

Bu rehberde, DNA dizilerini FASTA formatında hazırlama, temizleme ve analiz için uygun hale getirme adımlarını detaylı bir şekilde ele alacağız. FASTA formatı, DNA ve protein dizilerini saklamak ve paylaşmak için yaygın olarak kullanılan bir formattır. Bu format, bir başlık satırı (>) ve altında gelen dizi bilgisini içerir. Örneğin:

>Sequence_1
ATGCGATCGATCGATCGATCG
>Sequence_2
CGATCGATCGATCGATCGATC

Bu rehberde, aşağıdaki adımları takip edeceğiz:

1. Google Colab Ortamını Hazırlama: Analizlerimizi yapmak için gerekli kütüphaneleri yükleyeceğiz.
2. Örnek DNA Dizisini FASTA Formatında İndirme: İnternetten örnek bir FASTA dosyası indirip, yerel ortamımıza kaydedeceğiz.
3. FASTA Dosyasını Okuma ve İnceleme: İndirilen FASTA dosyasını okuyup, içeriğini inceleyeceğiz.
4. DNA Dizilerini Temizleme: DNA dizilerindeki gereksiz veya geçersiz karakterleri temizleyeceğiz.
5. DNA Dizilerinin Uzunluklarını Karşılaştırma: Dizilerin uzunluklarını analiz ederek, en kısa ve en uzun dizileri belirleyeceğiz.

Bu adımlar, DNA mutasyon analizi için gerekli olan veri hazırlık sürecini kapsar. Her adımda, kullanılan Python kodlarını ve bu kodların ne işe yaradığını detaylı bir şekilde açıklayacağız. Ayrıca, her adımın neden önemli olduğunu ve analiz sürecine nasıl katkı sağladığını da ele alacağız.

Bu rehber, biyoinformatik alanında yeni olanlar için temel bir başlangıç noktası sunarken, daha deneyimli kullanıcılar için de pratik bir kaynak olacaktır. Şimdi, ilk adım olarak Google Colab ortamını hazırlayarak başlayalım.