Mutasyon Analizi
DNA mutasyon analizi için dizileri FASTA formatında hazırlama, temizleme ve Colab ortamında işleme adımları.
Genetik analiz yaparken, FASTA formatındaki DNA dizilerini işlemeden önce bazı temel adımları takip etmemiz gerekir. İlk olarak, gerekli yazılım araçlarını ve kütüphaneleri yükleyerek ortamımızı hazırlıyoruz.
Google Colab Ortamını Hazırlama
Colab'de veya bilgisayarımızda çalışırken bazı özel kütüphanelere ihtiyacımız var. Bu yüzden ilk adım olarak Biopython kütüphanesini yüklüyoruz.
# Gerekli kütüphaneleri yükleyelim
!pip install biopython
import os
import requests
from Bio import SeqIO
🔹 Neden? Biopython, DNA ve protein dizilerini okumak, düzenlemek ve analiz etmek için kullanılan güçlü bir biyoinformatik kütüphanesidir.
Bu bölümde, DNA mutasyon analizi için gerekli olan FASTA formatındaki DNA dizilerini indirip, temizleyip, analiz için hazırladık. Artık bu verileri mutasyon tespiti ve daha ileri biyoinformatik analizler için kullanabiliriz.
Önemli Not:
Eğer gerçek genetik verilerle çalışıyorsanız, kaynak verilerin doğruluğunu ve etik kurallar çerçevesinde kullanımını göz önünde bulundurmalısınız.